Все нормально, эти рецепты работают только при постепенном улучшении
UPD: Просто ид механизма с разным улучшением одинаково, вот НЕИ и показывает такие рецепты вместе
Это не проблема Node.js, а выполнения сценариев JavaScript.
Попробуйте зайди в "Выполнить"(Win+R), прописать %appdata% и почистить папки связанные с Kaboom.
Если не помогло - обновите Java до последней версии, снеся перед этим все старые.