Мод может конфликтовать со многим, возможно стоит не та версия мода Applied Energistics 2, из-за чего он конфликтует, а другой версии мода с фикшеными дюпами просто может не найтись. Возможно конфликтует с ядром сервера, а переходить на другое ядро из-за одного аддона который чуть упрощает мод...